Cómo ganó el virus – The New York Times


Notas:
Nuestra comprensión del brote temprano en los Estados Unidos se basa en informes de casos, patrones de viaje, secuenciación genética y modelos de enfermedades que simulan el curso del brote en función de cómo se propagó y de lo que se sabe sobre el virus. Todos los modelos son estimados, y es imposible saber con certeza el origen de cada infección o el número de infecciones que no fueron confirmadas por las pruebas.

No hay recuentos oficiales completos de casos, muertes o pruebas en los Estados Unidos. Los casos conocidos provienen de una base de datos del New York Times basada en información de funcionarios federales, estatales y locales. Los casos se muestran por áreas estadísticas basadas en el núcleo, o por condado para casos fuera de esas áreas. Los primeros 15 casos están etiquetados por área estadística. Es posible que esas etiquetas no coincidan con los nombres de las ciudades exactas en las que se vieron los casos.

Los patrones de viaje que mostramos representan el movimiento entre áreas estadísticas basadas en el núcleo, basadas en datos agregados y anónimos de ubicación de teléfonos celulares recopilados por Cuebiq, una firma de inteligencia de datos que rastrea las ubicaciones de más de 15 millones de teléfonos celulares en los Estados Unidos. Los datos capturan viajes, no viajeros únicos, e incluyen viajes diarios entre áreas estadísticas y viajes de larga distancia. Algunas rutas menores y cortas no se muestran. Las reducciones en el movimiento debido al distanciamiento social se basan en mediciones realizadas por Cuebiq del rango medio que las personas en cada área viajan cada día. Los efectos del distanciamiento social son de Lauren Gardner, et al., “El distanciamiento social es efectivo para mitigar la transmisión de Covid-19 en los Estados Unidos”.

Las estimaciones de la cantidad de infecciones no detectadas en 11 ciudades estadounidenses provienen de modelos de la Northeastern University, al igual que las estimaciones de la cantidad de viajeros infectados no detectados que llegaron a los Estados Unidos desde otros países. Ver Matteo Chinazzi y Jessica T. Davis, et al. “El efecto de las restricciones de viaje en la propagación del nuevo brote de coronavirus (COVID-19) de 2019” Science.

Las estimaciones de la cantidad de personas contagiosas que dejaron Nueva York y Seattle provienen de modelos de Sen Pei y Jeffrey Shaman en la Universidad de Columbia. Las estimaciones del número de muertes que podrían haberse evitado con un distanciamiento social anterior son del Dr. Pei, et al., “Efectos diferenciales del tiempo de intervención sobre la propagación de Covid-19 en los Estados Unidos”.

Las muestras genéticas del virus son de Nextstrain. Mostramos las muestras agrupadas por nombres que fueron asignados antes del 1 de mayo de 2020. La conexión de los brotes estadounidenses para viajar desde la ciudad de Nueva York se basa en un análisis del Times de patrones de viaje y análisis de mutaciones genéticas por Trevor Bedford, profesor asociado, Fred Centro de Investigación del Cáncer Hutchinson y la Universidad de Washington.

Las conclusiones de los funcionarios federales de salud en febrero sobre la probable propagación del virus son de informes del Times. Trump dijo que los casos estarían cerca de cero en unos días en una conferencia de prensa del 26 de febrero. Los asesores de salud instaron a los estadounidenses a continuar con sus vidas normales en una conferencia de prensa el 29 de febrero. El Sr. de Blasio alentó a los neoyorquinos a hacer lo mismo en un tweet el 2 de marzo. Trump recomendó que los estadounidenses eviten viajar en una conferencia de prensa el 16 de marzo.

Fuentes adicionales:
• Xianding Deng, Charles Chiu et al., “Un estudio genómico del SARS-CoV-2 revela múltiples introducciones en el norte de California sin un linaje predominante”, Science

• Matthew Maurano, Adriana Heguy et al., “La secuencia identifica múltiples introducciones tempranas de SARS-CoV2 a la región de la ciudad de Nueva York”, medRxiv.org

• Ana S. González-Reiche, Harm van Bakel et al., “Introducción y propagación temprana del SARS-CoV-2 en el área de la ciudad de Nueva York”, Science





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